Tudela Serrano, José

Person:
Tudela Serrano, José

Name

Tudela Serrano, José

publication.page.department

Universidad de Murcia. Departamento de Bioquímica y Biología MolecularA

Full item page

Search Results

Now showing 1 - 7 of 7

Restricted
Kinetic characterization of the oxidation of catecolamines and related compounds by laccase
(Elsevier, 2020-07-25) Taboada Rodriguez, Amaury; Manzano Nicolás, Jesús; Teruel Puche, José Antonio; Marín Iniesta, Fulgencio; García Cánovas, Francisco; García Molina, Francisco; Tudela Serrano, José; Muñoz Muñoz, José Luis; Bioquímica y Biología Molecular A
The pathways of melanization and sclerotization of the cuticle in insects are carried out by the action of laccases on dopamine and related compounds. In this work, the laccase action of Trametes versicolor (TvL) on catecholamines and related compounds has been kinetically characterized. Among them, dopamine, l-dopa, l-epinephrine, l-norepinephrine, dl-isoprenaline, l-isoprenaline, dl-α-methyldopa, l-α-methyldopa and l-dopa methylester. A chronometric method has been used, which is based on measuring the lag period necessary to consume a small amount of ascorbic acid, added to the reaction medium. The use of TvL has allowed docking studies of these molecules to be carried out at the active site of this enzyme. The hydrogen bridge interaction between the hydroxyl oxygen at C-4 with His-458, and with the acid group of Asp-206, would make it possible to transfer the electron to the T1 Cu-(II) copper centre of the enzyme. Furthermore, Phe-265 would facilitate the adaptation of the substrate to the enzyme through Π-Π interactions. To kinetically characterize these compounds, we need to take into consideration that, excluding l-dopa, l-α-methyldopa and dl-α-methyldopa, all compounds are in hydrochloride form. Because of this, first we need to kinetically characterize the inhibition by chloride and, after that, calculate the kinetic parameters KM and VmaxS. From the kinetic data obtained, it appears that the best substrate is dopamine. The presence of an isopropyl group bound to nitrogen (isoprenaline) makes it especially difficult to catalyse. The formation of the ester (l-dopa methyl ester) practically does not affect catalysis. The addition of a methyl group (α-methyl dopa) increases the rate but decreases the affinity for catalysis. l-Epinephrine and l-norepinephrine have an affinity similar to isoprenaline, but faster catalysis, probably due to the greater nucleophilic power of their phenolic hydroxyl.
Open Access
Molecular docking studies of ortho-substituted phenols to tyrosinase helps discern if a molecule can be an enzyme substrate
(MDPI, 2024-06-23) Garcia-Molina, Pablo; Garcia-Canovas, Francisco; Garcia-Molina, Francisco; Montenegro Arce, María Fernanda; Rodríguez López, José Neptuno; Tudela Serrano, José; Bioquímica y Biología Molecuar A
Phenolic compounds with a position ortho to the free phenolic hydroxyl group occupied can be tyrosinase substrates. However, ortho-substituted compounds are usually described as inhibitors. The mechanism of action of tyrosinase on monophenols is complex, and if they are ortho-substituted, it is more complicated. It can be shown that many of these molecules can become substrates of the enzyme in the presence of catalytic o-diphenol, MBTH, or in the presence of hydrogen peroxide. Docking studies can help discern whether a molecule can behave as a substrate or inhibitor of the enzyme. Specifically, phenols such as thymol, carvacrol, guaiacol, eugenol, isoeugenol, and ferulic acid are substrates of tyrosinase, and docking simulations to the active center of the enzyme predict this since the distance of the peroxide oxygen from the oxy-tyrosinase form to the ortho position of the phenolic hydroxyl is adequate for the electrophilic attack reaction that gives rise to hydroxylation occurring.
Open Access
Estudio cinético de la fase de transición del mecanismo trisustrato hexa uni ping-pong.
(Murcia, Universidad de Murcia, Secretariado de publicaciones e intercambio científico, 1987) García Moreno, M.; García Cánovas, Francisco; Varón Castellanos, Ramón; García Carmona, Francisco; Román Gil, A.; Tudela Serrano, José; Facultad de Ciencias
El estudio cinético de las reacciones enzimáticas trisustrato se ha llevado a cabo bajo la aproximación del estado estacionario, la expresión de la ecuación de velocidad y sus distintas representaciones gráficas permiten distinguir entre los posibles mecanismos y obtener los parámetros cinéticos (KM y V^^,) que caracterizan al enzima actuando sobre los distintos sustratos (1-4). Sin embargo el enfoque en fase de transición, consigue una información más profunda sobre las distintas etapas del ciclo catalítico que tiene lugar en la transformación de los sustratos a productos. Estudios cinéticos en fase de transición, se han realizado fundamentalmente con reacciones enzimáticas monosustrato y bisustrato (5) y también se ha aplicado a un mecanismo trisustrato ordenado tipo Theorell-Chance (6). El grupo de mecanismos tipo Ping-Pong en reacciones trisustrato es muy amplio (4, 7). Respecto a enzimas que siguen un mecanismo Hexa Uni Ping-Pong,mejor estudiado en estado estacionario es piruvato-fosfato diquinasa de Propionibacterium shermanii (8) y de Bacillus symbiosus (9) que cataliza la conversión de piruvato, ATP y Pi a fosfoenolpiruvato, AMP y PPi. El objetivo de nuestro trabajo es obtener las ecuaciones cinéticas de formación de los productos, válidas tanto para la fase de transición como para el estado estacionario correspondientes al mecanismo (I), y establecer un método para la determinación de todas las constantes de velocidad implicadas en él, a partir de los perfiles concentracióntiempo de los productos, en el caso bastante frecuente de que en el sistema se den las condiciones de equilibrio rápido en la unión de los distintos sustratos
Open Access
Libro de Resúmenes de las Jornadassobre el EEES de la Facultad de Biología
(2009-07-01T15:17:08Z) Arnaldos Sanabria, María Isabel; Baños Páez, Pedro; Boronat Gil, Raquel; De Costa Ruiz, Jorge; Esteve Selma, Miguel A.; Farinós Celdrán, Pablo; García Charton, José Antonio; García García, María Dolores; Gómez Cerezo, Rosa María; Goncález Wangüemert, Mercedes; López Jiménez, José Ángel; Martínez Fernández, Julia; Martínez López, Francisco Javier; Martínez Paz, José Miguel; Mendiola López, Pilar; Millán Sánchez, Andrés; Oliva Paterna, Francisco José; Picazo Cordoba, Herminio; Pou Amérigo, Rosendo; Robledano Aymerich, Francisco; Suárez Alonso, María Luisa; Velasco García, Josefa; Vicente Soler, Jerónima; Vidal-Abarca Gutiérrez, María Rosario; Vidal Moreno, Cecilio; Bonmatí Carrión, María de los Ángeles; Quiles Ródenas, María José de Jesus; Campoy Menéndez, Francisco Javier; Tudela Serrano, José; Ubero Pascal, Nicolás; Facultad de Biología
Las Jornadas sobre la Adaptación al EEES en la Facultad de Biología forman parte de las actividades del Proyecto de Innovación Educativa de la Facultad de Biología "Iniciativas para la integración en el EEES", y pretenden difundir las experiencias desarrolladas en el marco de la Convergencia con el Espacio Europeo de Educación Superior a lo largo de estos últimos cinco años. Las Jornadas están abiertas a toda la comunidad universitaria que este interesada en conocer nuestras iniciativas, pero muy expecialmente a la relacionada con la Facultad de Biología
Open Access
Evaluation of rat liver with ARFI elastography: in vivo and ex vivo study
(Public Library of Science (PLoS), 2019-05-23) Carbonell, Guillermo; Oltra, Lidia; Garcia Carrillo, Nuria; Guzmán Aroca, Florentina; Salazar, Francisco Javier; Berná Mestre, Juan de Dios; Martínez Cáceres, Carlos Manuel; Berná Serna, Juan De Dios; Tudela Serrano, José; Dermatología, Estomatología, Radiología y Medicina Física
The aim of this study was to compare in vivo vs ex vivo liver stiffness in rats with acoustic radiation force impulse (ARFI) elastography using the histological findings as the gold standard. Eighteen male Wistar rats aged 16–18 months were divided into a control group (n = 6) and obese group (n = 12). Liver stiffness was measured with shear wave velocity (SWV) using the ARFI technique both in vivo and ex vivo. The degree of fibrosis, steatosis and liver inflammation was evaluated in the histological findings. Pearson’s correlation coefficient was applied to relate the SWV values to the histological parameters. The SWV values acquired in the ex vivo study were significantly lower than those obtained in vivo (P < 0.004). A significantly higher correlation value between the degree of liver fibrosis and the ARFI elastography assessment was observed in the ex vivo study (r = 0.706, P <0.002), than the in vivo study (r = 0.623, P < 0.05). Assessment of liver stiffness using ARFI elastography yielded a significant correlation between SWV and liver fibrosis in both the in vivo and ex vivo experiments. We consider that by minimising the influence of possible sources of artefact we could improve the accuracy of the measurements acquired with ARFI.
Open Access
Molecular docking studies of ortho-substituted phenols to tyrosinase helps discern if a molecule can be an enzyme substrate
(MDPI, 2024-06-23) García-Molina, Pablo; García-Cánovas, Francisco; García-Molina, Francisco; Montenegro Arce, María Fernanda; Rodríguez López, José Neptuno; Teruel Puche, José Antonio; Tudela Serrano, José; Bioquímica y Biología Molecular A
Phenolic compounds with a position ortho to the free phenolic hydroxyl group occupied can be tyrosinase substrates. However, ortho-substituted compounds are usually described as inhibitors. The mechanism of action of tyrosinase on monophenols is complex, and if they are ortho-substituted, it is more complicated. It can be shown that many of these molecules can become substrates of the enzyme in the presence of catalytic o-diphenol, MBTH, or in the presence of hydrogen peroxide. Docking studies can help discern whether a molecule can behave as a substrate or inhibitor of the enzyme. Specifically, phenols such as thymol, carvacrol, guaiacol, eugenol, isoeugenol, and ferulic acid are substrates of tyrosinase, and docking simulations to the active center of the enzyme predict this since the distance of the peroxide oxygen from the oxy-tyrosinase form to the ortho position of the phenolic hydroxyl is adequate for the electrophilic attack reaction that gives rise to hydroxylation occurring.
Open Access
Estudio cinético de la fase de transición del mecanismo de MichaeliS'Menten con inhibición por exceso de sustrato.
(Murcia, Secretariado de Publicaciones e Intercambio científico, Universidad de Murcia, 1985) Varón Castellanos, Ramón; García Carmona, Francisco; García Cánovas, Francisco; Tudela Serrano, José; Facultad de Ciencias (Química y Matemáticas)
En la literatura científica, desde el año 1965, se han descrito más de 800 enzimas que sufren desviaciones de la cinética de Michaelis-Menten, basándose en estudios de estado estacionario '. Estos hechos han animado a distintos autores a intentar explicar los resultados experimentales bajo enfoques más rigurosos que los utilizados previamente -. encontrando que a diferencia de la ecuación clásica de Michaelis-Menten, que es de grado 1:1 con respecto al sustrato, podrían darse grados tales como 1:2; 2:2; 2:3; 3:4; etc. Estos descubrimientos cuestionan fuertemente si debe aceptarse que las enzimas son en su mayoría michaelianas, ya que si esto no es así. los parámetros clásicos tales como KM y Vma, perderían su significado físico para tales enzimas. Es conocida la existencia de posibles causas que pueden dar lugar a desviaciones de la cinética de Michaelis-Menten •*. Algunos ejemplos son: la enzima que contiene una impureza que reacciona con el sustrato, o bien la enzima que existe en dos formas con diferentes actividades o en la que se producen agregaciones o micelas '. Algunas de las desviaciones cinéticas encontradas podrían deberse a tales hechos. No obstante, una vez suprimidos tales efectos donde es posible, ios hechos experimentales indican que son muchas las enzimas que dan cinéticas anómalas, entre ellas se encuentran acetilcolinesterasa, fosfatasa acida, adenosín desaminasa, ariisulfatasa, bencilamina oxidasa. a-quimotripsina, fumarasa, p-galactosidasa, galactosa deshidrogenasa, peroxidasa y xantín oxidasa ~. Algunas posibles causas cinéticas para explicar estas desviaciones podrían ser: a) inhibición por sustrato, b) activación por sustrato, c) rutas al azar, d) efectos alostéricos. El grupo más numeroso de desviaciones de la cinética de Michelis-Menten corresponde a la inhibición por sustrato (352 ejemplos). En la mayoría de los casos en los que aparece este tipo de efecto, lo que se ha hecho es trabajar a bajas concentraciones de sustrato, de tal manera que se obtenga una ecuación de velocidad 1:1 con respecto al sustrato y así poder definir KM y V„„. No obstante, se han utilizado en algunos trabajos ^ concentraciones elevadas de sustrato de tal manera que se obtiene la ecuación de velocidad real para el mecanismo bajo estudio; la regresión no lineal permite calcular los parámetros globales que aparecen bajo estas condiciones en la ecuación de velocidad. Sin embargo, el cálculo de las constantes de velocidad implicadas en el mecanismo no puede llevarse a cabo con datos únicamente de estado estacionario. La posibilidad del uso de técnicas rápidas permite obtener información sobre la fase de transición del sistema y la elucidación completa del mecanismo puede llevarse a cabo mediante la utilización conjunta de ambas técnicas ". Bajo este enfoque abordamos el estudio cinético del mecanismo más simple de inhibición por sustrato: mecanismo de Michaelis-Menten con inhibición por sustrato o bien mecanismo Uni-Uni con inhibición por sustrato.