Browsing by Subject "Segmentation"
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- PublicationOpen AccessA differential structure approach to membrane segmentation in electron tomography(2011-09) Martinez-Sanchez, Antonio; Inmaculada, García; Fernández, Jose-Jesús; Ingeniería de la Información y las ComunicacionesElectron tomography allows three-dimensional visualization of cellular landscapes in molecular detail. Segmentation is a paramount stage for the interpretation of the reconstructed tomograms. Although several computational approaches have been proposed, none has prevailed as a generic method and thus segmentation through manual annotation is still a common choice. In this work we introduce a segmentation method targeted at membranes, which define the natural limits of compartments within biological specimens. Our method is based on local differential structure and on a Gaussian-like membrane model. First, it isolates information through scale-space and finds potential membrane-like points at a local scale. Then, the structural information is integrated at a global scale to yield the definite segmentation. We show and validate the performance of the algorithm on a number of tomograms under different experimental conditions.
- PublicationOpen AccessA ridge-based framework for segmentation of 3D electron microscopy datasets(Elsevier, 2013-01) Martinez-Sanchez, Antonio; García, Inmaculada; Fernández, Jose-Jesús; Ingeniería de la Información y las ComunicacionesThree-dimensional (3D) electron microscopy (EM) has become a major player in structural cell biology as it enables the analysis of subcellular architecture at an unprecedented level of detail. Interpretation of the resulting 3D volumes strongly depends on segmentation, which consists in decomposing the volume into their structural components. The computational approaches proposed so far have not turned out to be of general applicability. Thus, manual segmentation still remains a prevalent method. Here, a new computational framework for segmentation of 3D EM datasets is introduced. It relies on detection and characterization of ridges (i.e. local maxima). The detected ridges are modelled as asymmetric Gaussian functions whose parameters constitute ridge descriptors. This local information is then used to cluster the ridges, which leads to the ultimate segmentation. In this work we focus on membranes and locally planar structures in general. The performance of the framework is illustrated with its application to a number of complex 3D datasets and a quantitative analysis.
- PublicationOpen AccessAnálisis del coste de oportunidad del fabricante en la segmentación de la distribución de productos de gran consumo(2018) Santos Jaén, José Manuel; Gimeno Arias, Fernando; Economía Financiera y ContabilidadEl propósito del trabajo presentado es el análisis de las consecuencias que para un fabricante o proveedor de bienes de gran consumo tiene la segmentación del canal de distribución, así como la exposición de éste a un fenómeno tan singular como es la presencia de un mercado paralelo y su coste de oportunidad asociado. Para ello, se describe el proceso de segmentación de la distribución en mercados de productos de gran consumo y sus criterios. Como resultado de la segmentación y de la presencia de una serie de intermediarios que obtienen beneficios económicos de dicha segmentación, encontramos unos costes de oportunidad para el fabricante no previstos en el diseño del canal que deberán ser incorporados en la evaluación de su distribución y por lo tanto deben de ser objeto de análisis pormenorizado por la contabilidad analítica de las empresas.
- PublicationOpen AccessColorectal cancer histopathology image analysis: A comparative study of prognostic values of automatically extracted morphometric nuclear features in multispectral and red-blue-green imagery(Universidad de Murcia. Departamento de Biología Celular e Histología, 2024) Liu, Wenlou; Qu, Aiping; Yuan, Jingping; Wang, Linwei; Chen, Jiamei; Zhang, Xiuli; Wang, Hongmei; Han, Zhengxiang; Li, Yan
- PublicationOpen AccessComparison of manual and automated digital image analysis systems for quantification of cellular protein expression(Universidad de Murcia, Departamento de Biologia Celular e Histiologia, 2022) Jagomast, T.; Idel, C.; Klapper, L.; Kuppler, P.; Proppe, L.; Beume, S.; Falougy, M.; Steller, D.; Hakim, S.G.; Offermann, A.; Roesch, M.C.; Bruchhage, K.L.; Perner, S.; Ribbat Idel, J.Objective. Quantifying protein expression in immunohistochemically stained histological slides is an important tool for oncologic research. The use of computer-aided evaluation of IHC-stained slides significantly contributes to objectify measurements. Manual digital image analysis (mDIA) requires a userdependent annotation of the region of interest (ROI). Others have built-in machine learning algorithms with automated digital image analysis (aDIA) and can detect the ROIs automatically. We aimed to investigate the agreement between the results obtained by aDIA and those derived from mDIA systems. Methods. We quantified chromogenic intensity (CI) and calculated the positive index (PI) in cohorts of tissue microarrays (TMA) using mDIA and aDIA. To consider the different distributions of staining within cellular subcompartments and different tumor architecture our study encompassed nuclear and cytoplasmatic stainings in adenocarcinomas and squamous cell carcinomas. Results. Within all cohorts, we were able to show a high correlation between mDIA and aDIA for the CI (p<0.001) along with high agreement for the PI. Moreover, we were able to show that the cell detections of the programs were comparable as well and both proved to be reliable when compared to manual counting. Conclusion. mDIA and aDIA show a high correlation in acquired IHC data. Both proved to be suitable to stratify patients for evaluation with clinical data. As both produce the same level of information, aDIA might be preferable as it is time-saving, can easily be reproduced, and enables regular and efficient output in large studies in a reasonable time period.
- PublicationEmbargoDifferences in residents’ social impact perception of a cycling event based on the fear of the COVID-19 pandemic(Taylor & Francis, 2021-03-24) Vegara-Ferri, José Miguel; Pallarés, Jesús G.; Angosto, Salvador; Actividad Física y Deporte©2021 Authors This document is the published version of a published work that appeared in final form in European Sport Management Quarterly To access the final edited and published work see: https://doi.org/10.1080/16184742.2021.1903526
- PublicationOpen AccessLa generación de destinos basados en experiencias enoturísticas para el segmento familiar(Universidad de Murcia. Servicio de publicaciones, 2021) Martínez del Vas, Ginesa; Beltrán Bueno, Miguel Ángel; Rubia Albert, LauraEl objetivo del presente artículo es descubrir los aspectos que más influyen en la configuración del producto familiar enoturístico e identificar las características que mejor definen el mismo. Para ello, se ha revisado la literatura al respecto y las páginas webs corporativas de diferentes empresas bodegueras y se han realizado entrevistas a responsables de algunas de dichas bodegas. Este estudio demuestra el potencial del segmento familiar en paralelo con el gran crecimiento de las experiencias diseñadas por las bodegas para el mismo, tratándose pues de una actividad económica emergente.
- PublicationOpen AccessEl mercado de trabajo agrario en la Comunidad Valenciana : equilibrio global versus desequilibrios espaciales y temporales(2002) Avellá Reus, Llorenç; Vega Carrero, Virginia; Editora Regional de MurciaEl presente artículo trata de determinar el equilibrio macroeconómico que se produce entre oferta y demanda de trabajo agrario en la Comunidad Valenciana y también a nivel provincial. Este equilibrio es posible por el trabajo irregular, que esconde importantísimos desequilibrios espaciales y temporales. Por ello, el análisis de este mercado exige analizar el componente estacional y espacial de oferta y demanda de trabajo agrario, lo que se ha realizado mediante una estimación realizada a partir de un amplio trabajo de campo, ya que no existe información estadística desagregada a los niveles requeridos comarcales y mensuales. Dada la estacionalidad y localización de las necesidades punta de demanda de mano de obra agraria, se precisa mano de obra flexible en tiempo y espacio, que la oferta registrada por las estadísticas de trabajo agrario no puede cubrir.
- PublicationOpen AccessRobust membrane detection based on tensor voting for electron tomography(Elsevier, 2014-04) Martinez-Sanchez, Antonio; García, Inmaculada; Asano, Shoh; Lucic, Valdan; Fernandez, Jose-Jesus; Ingeniería de la Información y las ComunicacionesElectron tomography enables three-dimensional (3D) visualization and analysis of the subcellular architecture at a resolution of a few nanometers. Segmentation of structural components present in 3D images (tomograms) is often necessary for their interpretation. However, it is severely hampered by a number of factors that are inherent to electron tomography (e.g. noise, low contrast, distortion). Thus, there is a need for new and improved computational methods to facilitate this challenging task. In this work, we present a new method for membrane segmentation that is based on anisotropic propagation of the local structural information using the tensor voting algorithm. The local structure at each voxel is then refined according to the information received from other voxels. Because voxels belonging to the same membrane have coherent structural information, the underlying global structure is strengthened. In this way, local information is easily integrated at a global scale to yield segmented structures. This method performs well under low signal-to-noise ratio typically found in tomograms of vitrified samples under cryo-tomography conditions and can bridge gaps present on membranes. The performance of the method is demonstrated by applications to tomograms of different biological samples and by quantitative comparison with standard template matching procedure.
- PublicationOpen AccessSegmentación de los Seniors en función de los productos que compran por internet: impacto en la industria turística(2017) Cristóbal-Fransi, Eduard; Ferrer-Rosell, Berta; Daries-Ramon, NataliaLos seniors se configuran como un colectivo de especial relevancia para un gran número de industrias. El cambio en el estilo de vida de la población mayor más orientada actualmente al disfrute del tiempo libre que generaciones anteriores y por tanto, más propensa a viajar, beneficia al sector turístico. Hasta ahora, estudios centrados en los seniors han analizado su comportamiento como algo homogéneo en comparación con otras franjas de edad. En esta investigación, con una muestra útil de 2.541 individuos, partimos de la consideración que dicho grupo es heterogéneo, con distintas características y niveles de uso de Internet, y proponemos, mediante una clasificación, tres perfiles de internautas seniors en función de los productos comprados en línea. Encontramos un segmento que utiliza Internet para comprar, sobretodo, productos y servicios turísticos. En las conclusiones se presentan las reflexiones más significativas sobre los segmentos obtenidos y su implicación en la gestión.