Publication: Genetic screening of diploid and tetraploid cotton cultivars
based on retrotransposon microsatellite amplified polymorphism
markers (REMAP)
Authors
Noormohammadi, Zahra ; Ibrahim-Khalili, Niloofar ; Ghasemzadeh-Baraki, Somayeh ; Sheidai, Masoud ; Alishah, Omran
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Publisher
Universidad de Murcia
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Description
Abstract
Abstract
Continuous artificial selection and cultivation of cultivars has led to
genetic erosion and loss of useful genetic loci from the available
germplasm. The objective was to evaluate diploid and tetraploid
cottons cultivars with REMAP. Low genetic variability within each
cultivar was observed, but a high genetic variability occurred within
each species (18-68%). AMOVA test revealed 63% of total genetic
variability occurred due to among species genetic difference.
Unique alleles were detected in the studied species, that can be
used for species discrimination. REMAPs could efficiently discriminate
the studied diploid from tetraploid species and may be useful
for fast screening, as genetic fingerprinting of large cotton
germplasm and for planning future hybridization programs.
Resumen: La selección artificial continuada y el uso de variedades ha llevado a erosión genética y pérdida de loci genéticos del germoplasma disponible. El objetivo fue evaluar variedades diploides y tetraploides de algodón por REMAP. Se observó baja variabilidad gené- tica dentro de cada variedad, pero alta dentro de cada especie (18- 68%). El AMOVA reveló que el 63% de la variabilidad genética total se produjo debido a diferencia entre especies. Se detectaron alelos únicos en las especies estudiadas, que pueden ser empleados para discriminación. REMAP podrían discriminar eficazmente las especies diploides de las tetraploides y ser últiles para el cribado rápido, actuar como huella genética del gran germoplasma de algodón y para la planificación de programas de hibridadción.
Resumen: La selección artificial continuada y el uso de variedades ha llevado a erosión genética y pérdida de loci genéticos del germoplasma disponible. El objetivo fue evaluar variedades diploides y tetraploides de algodón por REMAP. Se observó baja variabilidad gené- tica dentro de cada variedad, pero alta dentro de cada especie (18- 68%). El AMOVA reveló que el 63% de la variabilidad genética total se produjo debido a diferencia entre especies. Se detectaron alelos únicos en las especies estudiadas, que pueden ser empleados para discriminación. REMAP podrían discriminar eficazmente las especies diploides de las tetraploides y ser últiles para el cribado rápido, actuar como huella genética del gran germoplasma de algodón y para la planificación de programas de hibridadción.
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