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    Aportación al conocimiento de la brioflora navarra. El Robledal de Elzaburu (Navarra)
    (Universidad de Murcia, Servicio de Publicaciones, 1984) Miguel, A. de; Ederra Induráin, A.; Facultad de Biología
    The bryological flora of Quercus robur wood of Elzaburu (Navarra) is studied. A catalogue of 78 species (25 liverworts and 53 mosses) is given. A comparative study between this Quercus robur wood and acidophile atlantic Fagus sylvatica woods, studied in precedent years, is made.
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    Aportaciones al conocimiento de la brioflora de los Pirineos
    (Universidad de Murcia, Servicio de Publicaciones, 1984) Manobens Rigol; Facultad de Biología
    Nouvelles localités pyrennéennes pour 1 hepatique et 1 1 mousses. Cephaloziella rubella, Stegonia latifolia, Amblyodon dealbatus ou Lescuraea plicata, sont peu connues pour I'Espagne.
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    Aportaciones al conocimiento de la flora briológica española. Nótula VI: musgos y hepáticas del Macizo del Moncayo
    (Universidad de Murcia, Servicio de Publicaciones, 1984) Casas, C.; Fuertes, E.; Varo, J.; Facultad de Biología
    A study of the Bryophytic flora of the Moncayo, following a series dedicated to the Sistema Ibérico. The intensive collection made with the collaboration of the assistents have made possible the identification of 30 hepaticae and 142 mosses, between which there are 34 of the 37 species determinated by TONGLET in 1903. We remark the presence of species such as: Calypogeia muelleriana, Ptilidium ciliare, Sphenolobus minutus, Brachythecium reflexum, Calliergon cordifolium, Desmatodon latifolius, Didymodon cordatus, Ephemerum serratum, Grimmia anodon, Homomallium incurvatum, Lescuraea patens, L. radicosa, Seligeria pusiIla.
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    Conferencia: ' "Musgos y Hepáticas de Zonas Áridas: Especialistas en Sobrevivir"
    (2007-09-19) Urbina, Luis
    Conferencia: ' "Musgos y Hepáticas de Zonas Áridas: Especialistas en Sobrevivir" , a cargo de Rosa María Ros Espín (UMU). Organiza: Asociación Murciana de Amigos de las Plantas (AMAP) y CAM. Salón de Actos Aula de Cultura CAM. (18-09-07).
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    Ensayo briosociológico y ecológico de la Foz de Arbayún (Navarra)
    (Universidad de Murcia, Servicio de Publicaciones, 1984) Miguel, A. de; Ederra Induráin, A.; Facultad de Biología
    As a complement of the study of the bryological flora of Foz de Arbayún (Navarra), explained in the IV ((Simposium)) of Criptogamous Botany, an amplified catalogue of Bryophytes (1 23 species: 30 liverworts and 93 mosses), reporting their ecology is given. The most representative moss comunities: terrestial, saxicolous, corticolous and aquatic, are analysed
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    Estudio del ciclo reproductivo de algunas especies de musgos
    (Murcia : Universidad de Murcia, Servicio de Publicaciones, 1984) Lloret, F.; Pérez, R.; Facultad de Biología
    The reproductive cycle of the mosses Polytrichum formosum Hedw., Bartramia pomiformis Hedw., Grimmia laevigata (Brid.) Brid. and Hedwigia ciliata (Hedw.) P. Beauv. has been investigated by scoring specimens from Montseny Mountains (Barcelona. Spain) (UTM: DG 46 26). Gametangial formation, fertilization, growth of the sporophytes and spore dispersa1 are correlated with seasonal variation of the environmental factors.
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    Estudio del contenido de metales pesados en briófitos del área metropolitana de Barcelona
    (Universidad de Murcia, Servicio de Publicaciones, 1984) Perez i Obiol, Ramon; Facultad de Biología
    Highways with high intensity of traffic and other significant places of the Metropolitan Area of Barcelona were studied. We have sampled several moss species testing them by spectrophotometer of atomic absorption, determining concentrations of heavy metals and comparing different location results.
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    Flora briofítica del Parque Natural Montes de Málaga y su entorno (Sur de España)
    (Universidad de Murcia. Servicio de publicaciones, 2022) Guerra, Juan; Jiménez, Juan Antonio; Cano, María José; Rodríguez, Omar; Cabezudo, Baltasar
    Se realiza un estudio de la flora briofítica del Parque Natural Montes de Málaga y su entorno, mediante la recolección en un total de 34 localidades. La diversidad briofítica se ha estimado en 125 especies, de las cuales 109 son musgos y 16 hepáticas, no se han encontrado antocerotas. Aschisma cuynetii, Bryum gemmiferum, B. radiculosum, Crossidium aberrans, Fissidens bryoides, Geheebia siccula, Gymnostomum lanceolatum, Pottiopsis caespitosa, Riccia bicarinata, R. ciliifera, R. papillosa, Trichostomum meridionale y Weissia levieri se citan por vez primera de la provincia de Málaga. Rhynchostegiella tubulosa se menciona como novedad para la brioflora de España.
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    Hepáticas de La Rioja
    (Universidad de Murcia, Servicio de Publicaciones, 1984) Fuertes, E.; Mendiola, A.; Facultad de Biología
    In this paper the list of the Hepaticae species and their distribution in La Rioja are reported.
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    Lewinskya laevigata (J.E. Zetterst.) F. Lara et al. (Bryophyta, Orthotrichaceae) en Sierra Nevada (España)
    (Universidad de Murcia, 2019) Guerra, Juan
    Lewinskya laevigata (J.E. Zetterst.) F. Lara et al., un musgo árticoalpino, muy raro en el área mediterránea, se cita por segunda vez en la Península Ibérica. La muestra ha sido recolectada en los Peñones de San Francisco (Sierra Nevada, España).
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    Long distance dispersal, local adptation and long term persistence in bryophytes : studies in the moss Bryum argenteum= Dispersión a larga distancia, adaptación local y persistencia a largo plazo en briófitos: estudios en el musgo Bryum argenteum
    (2015-12-01) Pisa Martín, Sergio; Werner, Olaf Franziskus; Ros Espín, Rosa María; Facultad de Biología
    Los briófitos, en comparación con las plantas con semilla, se dispersan a mayores distancias, tienen mayor amplitud ecológica, menos endemismos y distribuciones geográficas más amplias. Dos hipótesis se han discutido tradicionalmente para explicar sus amplias y disyuntas distribuciones. La primera lo interpreta como resultado de la fragmentación de una antigua distribución continua (vicarianza). La segunda lo explica como consecuencia de la dispersión intercontinental. En general, los estudios genéticos sugieren que ha habido dispersión intercontinental durante la diversificación de briófitos, pero no la suficiente como para evitar la diferenciación alopátrica. Los briófitos cosmopolitas exhiben una baja, quizás insignificante, estructura filogeográfica entre continentes, apoyando la hipótesis de dispersión sobre la de vicarianza. Esto hace preguntarse si la dispersión es ubicua y los variantes de una determinada especie cosmopolita se distribuyen homogéneamente. El principio de Baas Becking postula que "todo está en todas partes, pero el ambiente selecciona”. Las características de los briófitos cosmopolitas los hacen candidatos ideales para probar el principio de Baas Becking, aunque estos no han sido testados, hasta ahora. Por otro lado, si se encontraran límites a la dispersión y por tanto se rechazara la hipótesis del principio de Baas Becking, los briófitos cosmopolitas podrían haber logrado su distribución global ayudados por actividades humanas. Esta hipótesis podría verse reforzada por su afinidad a hábitats perturbados, que recuerda el comportamiento de especies invasoras. Esta tesis aborda diferentes hipótesis concernientes a la ecología, distribución, historia y potencial invasivo de plantas con capacidad para dispersarse a larga distancia y más en concreto, de briófitos cosmopolitas, usando Bryum argenteum como especie modelo. En particular, esta tesis trata del principio de Baas Becking tanto a escala mundial como local, en las montañas de Sierra Nevada (España) y la isla de Tenerife. Además, otras hipótesis fueron testadas en base a los resultados preliminares incluyendo la reciente colonización o la persistencia in situ de B. argenteum en el continente Antártico y discernir si colonizó Tenerife de forma artificial o natural. La metodología aplicada incluye el uso de secuencias genéticas de numerosas muestras recolectadas en Sierra Nevada, Tenerife y en todas las masas continentales. Las secuencias fueron analizadas con técnicas de genética de poblaciones y filogeografía incluyendo análisis comparativos, estimadores de diversidad genética, tests de correlación (tests de Mantel), estimadores de estructura genética entre poblaciones, reconstrucciones de áreas ancestrales, datación de reloj molecular y tests de neutralidad. Las conclusiones generales de esta tesis son: • Las evidencias en Sierra Nevada apoyan la primera mitad de la hipótesis de Baas Becking “Todo está en todas partes” a escala local. Por el contrario, la estructura genética en Tenerife sugiere que la deriva génica juega también un papel en el establecimiento de los patrones de variación genética. • El medio ambiente impulsa la diferenciación genética tanto en Sierra Nevada como en Tenerife, apoyando la segunda mitad del principio de Baas Becking “el ambiente selecciona” a escala local. Así que los briófitos cosmopolitas podrían formar ecotipos. • El factor clave que explica la distribución genética mundial de B. argenteum es la dispersión intercontinental recurrente. Sin embargo, la dispersión no es ubicua y por tanto, se rechaza la hipótesis del principio de Baas Becking a escala global. • La Antártida está mucho más aislada en términos de dispersión de briófitos que cualquier otro continente. • B. argenteum colonizó la Antártida al menos en tres ocasiones persistiendo en el continente durante varios ciclos glaciales. En Sierra Nevada, la especie se mantuvo en una zona glaciar durante el pleistoceno tardío. • B. argenteum colonizó la isla de Tenerife en múltiples ocasiones. Las primeras colonizaciones tuvieron lugar mucho antes de los primeros asentamientos humanos. Abstract The bryophytes, in contrast with seed plants, are capable to disperse over longer distances, have broader ecological amplitudes, less endemism and wider geographical distributions. Two hypotheses have been traditionally discussed to explain their broad and disjunctive geographical distributions. The first hypothesis interprets it as a result of fragmentation of ancient continuous distributions (i.e. vicariance). The second explains it as a consequence of intercontinental dispersal. In general, genetic studies suggest that dispersal among continents has occurred repeatedly during bryophyte diversification, although it has not been recurrent enough to prevent allopatric differentiation. Research on cosmopolitan bryophytes indicates that they exhibit a low, potentially negligible, structure among continents favouring the long distance dispersal hypothesis over vicariance. This raises the question of whether dispersal is ubiquitous and the variants of cosmopolitan species are distributed everywhere. The Baas Becking tenet posits that ‘everything is everywhere, but the environment selects’ (EiE). The peculiar characteristics of cosmopolitan bryophytes suggest that they are ideal candidates to test the EiE tenet, yet they remained untested until now. On the other hand, if there were limits to dispersal at a global scale and, thus, the EiE hypothesis would be rejected, cosmopolitan bryophytes might have achieved their global distribution aided by anthropogenic activities. This hypothesis might be reinforced by the affinity of cosmopolitan bryophytes to disturbed habitats, which is reminiscent of invasive species’ behaviour. This thesis addresses a variety of hypothesis regarding the ecology, distribution, history and potential invasiveness of vagile plants and more specifically, of cosmopolitan bryophytes, taking the moss Bryum argenteum as a model species. In particular, this thesis deals with the EiE tenet at global scale and locally on the Sierra Nevada Mountains (Spain) and on the island of Tenerife. Additionally, based on preliminary findings, further hypotheses were tested including the recent colonization or in situ persistence of the species in the Antarctic continent and the assessment of the potential alien status of B. argenteum on Tenerife. The methodology applied includes the use of genetic sequences from numerous accessions sampled from Spanish Sierra Nevada Mountains, the island of Tenerife and from each of the continental masses on Earth. The DNA sequences were analysed with statistical techniques from the fields of population genetics, and phylogeography such as comparative analyses, genetic diversity estimators, correlation tests (Mantel tests), estimators of genetic differentiation, ancestral areas reconstructions, molecular dating and tests of neutrality. The main conclusions of this thesis are: • Evidence in Sierra Nevada Mountains supports the first half of the EiE tenet “Everything is everywhere” at a local scale. On the contrary, the spatial genetic structure found in Tenerife suggests that genetic drift plays also a role in establishing patterns of genetic variation. • Evidence for an environmentally-driven pattern of genetic differentiation in both, Sierra Nevada and Tenerife, indicates that the second half of the EiE tenet, “the environment selects” applies at a local scale in B. argenteum. Therefore, cosmopolitan bryophytes may form ecotypes. • Recurrent intercontinental dispersal is the key factor that explains the worldwide genetic distribution of B. argenteum. However, dispersal is not ubiquitous but limited. Thus, the EiE tenet is rejected at a global scale. • The Antarctic continent is by far the most isolated continent of all in terms of bryophyte dispersal. • B. argenteum colonized the Antarctica on at least three occasions and successfully persisted in the continent during several glacial cycles. Evidence in Sierra Nevada suggests long term persistence in a range that was glaciated during the late Pleistocene. • B. argenteum colonized the island of Tenerife on multiple occasions. Earlier events of colonization on the island took place well before the first human settlements.
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    Novedades corológicas para la flora briofítica ibérica. X
    (Universidad de Murcia. Servicio de publicaciones, 2024) Cano, María Jesús; Guerra, Juan; Mellado Díaz, Andrés; Jiménez, Juan Antonio
    A partir del estudio de muestras recolectadas en los últimos años y revisión de especímenes de herbario, se aportan un total de 23 novedades corológicas provinciales para España. Hyophila involuta, una especie conocida únicamente de una localidad ibérica en el valle de Baztán en Navarra, se cita aquí de cinco nuevas localidades, siendo novedad para Cantabria y País Vasco. Destaca también el hallazgo de Didymodon desertorum que es novedad para Castilla y León, Cataluña y Galicia. Se aporta, además, una nueva localidad para Scopelophila cataractae especie catalogada como vulnerable en España.
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    Open Access
    Physcomitrella patens (hedw.) B.S.G. en el Alt Empordà (Girona)
    (Universidad de Murcia, Servicio de Publicaciones, 1984) Álvaro Martín, María Isabel; Facultad de Biología
    This moss has been reported for the first time in Spain, by CASARES (1 905). This is on account of the second collection, now in Alt Emporda (Girona).
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    Revisión taxonómica el género Hypnum Hedw : (Bryophyta, Hypnaceae) en la península ibérica, Islas Baleares y Macaronesia
    (2017-03-01) Ríos Poveda, Diana; Guerra Montes, Juan; Gallego Morales, María Teresa; Facultad de Biología
    Objetivos: El género Hypnum Hedw. es uno de los más problemáticos de la familia Hypnaceae Schimp. La complejidad del mismo reside en la amplitud de su distribución, la elevada variabilidad morfológica y la falta de determinación de sus caracteres diferenciales. Aunque muchos autores han trabajado en su taxonomía, no existen estudios concretos de la Península Ibérica, Islas Baleares y Macaronesia. En este trabajo se propone realizar la revisión taxonómica del género Hypnum en Andorra, España, Portugal y su territorio insular. El resultado será un tratado monográfico que cumpla con el objetivo principal de actualizar el conocimiento sobre el género Hypnum en el área de estudio. Metodología: Se llevó a cabo la recopilación de las descripciones originales de los taxones de Hypnum conocidos del área a analizar y se estudió el material tipo de cada uno de ellos. Se realizó el estudio morfológico de cerca de 3080 especímenes, provenientes de herbarios institucionales. Se registraron medidas de los caracteres morfológicos determinados como distintivos en una base de datos, y se hicieron fotografías y dibujos de todos los taxones. Se realizaron mapas de distribución para cada uno de los taxones, utilizando el programa Arc View GIS (ESRI 2006). Se llevó a cabo un estudio filogenético de las regiones trnL-F, atpB-rbcL, ITS y 26S, en el que se incluyeron diferentes taxones de Hypnum del área de estudio y especies del orden Hypnales. Conclusiones: El género Hypnum está representado en el área de estudio por 17 taxones [H. andoi A. J. E. Sm., H. callichroum Brid., H. cupressiforme Hedw. var. cupressiforme Hedw., H. cupressiforme var. filiforme Brid., H. cupressiforme var. julaceum Brid., H. cupressiforme var. lacunosum Brid., H. cupressiforme var. resupinatum (Taylor) Schimp., H.cupressiforme var. subjulaceum Molendo, H. hamulosum Schimp., H. imponens Hedw., H. jutlandicum Holmen & E. Warncke, H. pallescens (Hedw.)P. Beauv., H. procerrimum Molendo, H. recurvatum (Lind. & Arnell) Kindb., H. revolutum (Mitt.) Mönk., H. uncinulatum Jur. y H. vaucheri Lesq.]. Se ha comprobado la validez de los caracteres morfológicos tradicionales y se aportan datos nuevos en referencia a los pseudoparafilos y las células alares. Se lectotipifican los nombres de 11 taxones. Se aportan 12 sinónimos nuevos. Se actualiza la distribución del género en el área estudiada, ampliándose en 94 citas nuevas para distintas provincias de España y 24 nuevas citas para Portugal. Además, 6 taxones se citan por primera vez para 5 países. Los taxones del orden Hypnales analizados filogenéticamente presentan poca variabilidad genética entre ellos. El género Hypnum es polifilético, al igual que la familia Hypnaceae. Hypnum hamulosum, H. imponens, H. pallescens, H. procerrimum, H. recurvatum, H. revolutum e H. vaucheri, están alejadas filogenéticamente de la especie tipo del género, H. cupressiforme. Las especies H. cupressiforme, H. andoi, H. uncinulatum e H. jutlandicum son filogenéticamente muy cercanas, ya que se relacionan en una gran politomía en los análisis realizados. Las variedades de H.cupressiforme no se diferencian lo suficiente genéticamente como para elevar ninguna de ellas a categoría específica.   Abstract Goals: The genus Hypnum Hedw. is one of the most problematical groups in the family Hypnaceae Schimp. This is due to a broad distribution of the species, a high variability in their morfology and an absence of determination in their differential characters. Although several authors have worked in its taxonomy, there are not specific studies in the Iberian Peninsula, Balearic Islands and Macaronesia. In this work we propose carry out the taxonomical revision of the genus Hypnum in Andorra, Spain and Portugal. The result will be a monographic work with the main goal of updating the knowledge about the genus Hypnum in the study area. Methodology: A collection of all original descriptions of taxa included in Hypnum from the study area was carried out and the type material from each taxa was studied. The morphological study was based in nearly 3080 specimens from institutional herbaria. Numerous measures of distinctive morphological characters were recorded in a database, and photographs and drawings of all taxa were made. Distribution maps for each of the taxa were performed using the program Arc View GIS (ESRI 2006). A phylogenetic study of DNA regions trnL-F, atpB-rbcL, ITS y 26S, of different taxa of Hypnum and species of the order Hypnales was made. Conclusions: The genus Hypnum is represented in the study area by 17 taxa [H. andoi A. J. E. Sm., H. callichroum Brid., H. cupressiforme Hedw. var. cupressiforme Hedw., H. cupressiforme var. filiforme Brid., H. cupressiforme var. julaceum Brid., H. cupressiforme var. lacunosum Brid., H. cupressiforme var. resupinatum (Taylor) Schimp., H.cupressiforme var. subjulaceum Molendo, H. hamulosum Schimp., H. imponens Hedw., H. jutlandicum Holmen & E. Warncke, H. pallescens (Hedw.)P. Beauv., H. procerrimum Molendo, H. recurvatum (Lind. & Arnell) Kindb., H. revolutum (Mitt.) Mönk., H. uncinulatum Jur. and H. vaucheri Lesq.]. The validity of traditional morphological characters has been checked and new data are given about the pseudoparaphyllia and alar cells. 11 taxa was lectotypified and 12 new synonyms are provided. The distribution of the genus in the study area was updated, expanding in 94 new places in Spain and 24 in Portugal. In addition, 6 taxa are cited for the first time for 5 countries. The taxa of the order Hypnales analyzed in the phylogenetic study have low variability. The genus Hypnum is poliphylletic, as same as the Hypnaceae family. Hypnum hamulosum, H. imponens, H. pallescens, H. procerrimum, H. recurvatum, H. revolutum and H. vaucheri, are phylogenetically distant from the type species of the genus, H. cupressiforme. The species H. cupressiforme, H. andoi, H. uncinulatum and H. jutlandicum are phylogenetically very close, included in a polytomy in the analyzes. The varieties of H. cupressiforme don't have enough genetic differences to raise them to any specific category.
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    Publication
    Open Access
    The genera Chionoloma, Oxystegus, Pachyneuropsis and Pseudosymblepharis (Pottiaceae, Bryophyta) : taxonomy and phylogenetic relationships
    (Universidad de Murcia, 2019-06-06) Alonso García, Marta; Cano Bernabé, María Jesús; Jiménez Fernández, Juan Antonio; Facultad de Biología
    Resumen. La familia Pottiaceae incluye el mayor número de especies de musgos y su taxonomía es una de las más complejas dentro de los briófitos. La circunscripción de sus géneros ha generado controversia desde la descripción de la familia. En esta tesis se estudian cuatro géneros de las Pottiaceae pertenecientes a la subfamilia Trichostomoideae: Chionoloma Dixon, Oxystegus (Limpr.) Hilp., Pachyneuropsis H.A. Mill. y Pseudosymblepharis Broth. Los principales objetivos son (i) resolver las relaciones filogenéticas entre los cuatro géneros reconocidos a partir de marcadores nucleares y cloroplásticos; (ii) aportar una síntesis taxonómica de las especies de Chionoloma, Oxystegus, Pachyneuropsis y Pseudosymblepharis en todo el mundo y (iii) buscar nuevos marcadores moleculares de utilidad filogenética mediante el ensamblaje de los genomas cloroplásticos y mitocondriales de dos especies de estos géneros, Oxystegus tenuirostris var. tenuirostris (Hook. & Taylor) A.J.E. Sm. y Pseudosymblepharis schlimii M. Alonso, M.J. Cano & J.A. Jiménez. Con el fin de cumplir el primer objetivo se lleva a cabo una filogenia a partir de los marcadores nrITS, atpB-rbcL, trnG and trnL-F. La monofila de estos cuatro géneros se investiga usando análisis de máxima verosimilitud e inferencia bayesiana. La reconstrucción de caracteres ancestrales muestra un alto nivel de homoplasia en los caracteres morfológicos tradicionalmente usados para separar estos cuatro géneros. Según estos resultados, se sugiere que Chionoloma, Oxystegus y Pseudosymblepharis deberían unirse en un solo género, siendo Chionoloma el nombre prioritario. La posición taxonómica de Pachyneuropsis requiere de más estudios para poder ser clarificada. La revisión taxonómica se basa en más de 2.600 especímenes depositados en diferentes herbarios o recolectados durante campañas de muestreo. Se han identificado un total de 131 nombres y se han examinado sus correspondientes tipos nomenclaturales, lectotipificando 69 nombres. Como resultado de esta revisión se aportan claves dicotómicas, descripciones, dibujos, fotografías y datos de distribución de cada una de las especies reconocidas. Tras el estudio taxonómico se concluye que el género Chionoloma está compuesto por 22 especies y una variedad. De estas especies, 18 se proponen como nuevas combinaciones y se describe e ilustra una especie nueva para la ciencia. Además, 56 nombres son sinonimizados y se aportan 87 nuevas citas para varios países. Por su parte, los resultados relativos al género Pachyneuropsis muestran que éste consta de dos especies, una de ellas combinada en este trabajo, y se consideran dos nuevos sinónimos. La búsqueda de nuevos marcadores moleculares se basa en estudios genómicos centrados en completar los genomas de los orgánulos de dos especies de este grupo. Únicamente el genoma mitocondrial de la especies Chionoloma tenuirostre var. tenuirostre ha sido ensamblado y anotado. El genoma está formado por 105.001 pb, con un contenido en GC de 39,2%, incluyendo 40 genes que codifican proteínas, 24 tARN y 3 rARN. Se hallan presentes todos los intrones, excepto uno, que no se ha documentado en musgos con perístoma, y no se han encontrado regiones repetidas de 50 pb. El contenido en genes y su orden es idéntico al de la mayoría de los musgos, recalcando que el genoma mitocondrial es estable no sólo a lo largo de los distintos linajes vegetales, sino también específicamente dentro del clado de los musgos. Un árbol filogenético es inferido a partir del genoma de 16 especies de musgos para validar la secuencia de C. tenuirostre var. tenuirostre, confirmando que comparte ancestro común con Syntrichia Brid. En resumen, esta tesis constituye no solo el primer trabajo filogenético de los géneros Chionoloma, Oxystegus, Pachyneuropsis y Pseudosymblepharis, sino también la primera revisión taxonómica del grupo a nivel mundial y uno de los pocos estudios de genómica de briófitos llevados a cabo hasta el momento.   Abstract. Pottiaceae is the largest known moss family, with one of the most complex taxonomies among the bryophytes. The circumscription of genera within the Pottiaceae is challenging and it has been a matter of dispute ever since the establishment of the family. In this thesis, four related genera belonging to the Pottiaceae subfamily Trichostomoideae are studied: Chionoloma Dixon, Oxystegus (Limpr.) Hilp., Pachyneuropsis H.A. Mill. and Pseudosymblepharis Broth. The main goals of this work are (i) to resolve phylogenetic relationships among these four related traditional genera of the Pottiaceae inferring a phylogeny derived from nuclear and the plastid markers; (ii) to provide a comprehensive taxonomic synthesis of the species placed within Chionoloma, Oxystegus, Pachyneuropsis and Pseudosymblepharis worldwide and (iii) to search for new molecular markers of potential phylogenetic utility by assembling the chloroplast and mitochondrial genome of two species of these genera, Oxystegus tenuirostris var. tenuirostris (Hook. & Taylor) A.J.E. Sm. y Pseudosymblepharis schlimii M. Alonso, M.J. Cano & J.A. Jiménez. In order to achieve the first goal, a phylogeny derived from nuclear ITS and the plastid markers atpB-rbcL, trnG and trnL-F is inferred. Putative monophyly of these four genera is investigated using maximum likelihood and Bayesian inference analyses. Ancestral state reconstruction shows high levels of homoplasy in the characters historically used for the generic division of Chionoloma s.l. Based on the results, it is suggested that Chionoloma, Oxystegus and Pseudosymblepharis should be merged into a single genus, for which the oldest name Chionoloma has priority. Additional analyses are needed to clarify the taxonomic status of Pachyneuropsis. The taxonomic revision is based on more than 2,600 specimens deposited in different herbaria or collected during filed trips. A total of 131 names are found and their nomenclatural types are examined, carrying out the lectotypification of 69 names. As a result of this revision, keys, descriptions, illustrations, photographs and distribution data of each species are provided. After the taxonomic study, it is concluded that Chionoloma is composed of 22 species and one variety, 18 of them are here newly combined and a new species is described and illustrated. Moreover, 56 names are newly synonymized and a total of 87 new records for various countries are reported. On its behalf, results related with Pachyneuropsis show that this genus includes two species, being one of them a new combination. Besides, two names are considered as new synonyms. The search for new molecular markers is based on genomic studies focus on complete the organellar genome of two species of this group. Just the mitochondrial genome of the species Chionoloma tenuirostre var. tenuirostre is assembled and annotated. The genome is 105,001 bp long, with a GC content of 39.2%, comprising 40 protein coding, 24 tRNA, and 3 rRNA genes. All introns reported from the mitochondrial genome of all but one peristomate moss are present, whereas no 50 bp region is repeated within the genome. The genic content and order is identical to that of most mosses, highlighting that the mitochondrial genome is static not only across the phylogenetic depth but also breadth of the moss tree of life. A phylogenetic tree is inferred from the whole genome of 16 species of mosses to validate the sequence of C. tenuirostre var. tenuirostre by confirming its shared ancestry with Syntrichia Brid. Broadly, this thesis constitutes not only the first phylogenetic study of the genera Chionoloma, Oxystegus, Pachyneuropsis and Pseudosymblepharis but also the first taxonomic revision of this group and one of the few genomic studies with bryophytes performed so far.
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    Publication
    Open Access
    Variabilidad genética en musgos y su relación con procesos adaptativos al cambio climático en ambientes mediterráneos= Genetic variability in mosses and its relation to climate change adaptation processes in mediterranean environments
    (2013-07-24) Magdy Abdallah Awad, Mahmoud; Werner, Olaf Franziskus; Ros Espín, Rosa María; Facultad de Biología
    Se ha estudiado variabilidad genética en el musgo Funaria hygrometrica y su relación con los procesos de adaptación al cambio climático en la alta montaña Mediterránea de Sierra Nevada (España). Para ello se han secuenciado cuatro regiones del ADN (espaciadores nuclear ITS1 e ITS2, la región cloroplastidial rps3-rpl16 y la mitocondrial rpl5-rpl16). Asimismo se han usado dos técnicas de fingerprinting (microsatélites y AFLP). Se ha aplicado el método de exploración del genoma sobre los datos AFLP para detectar loci sometidos a selección. Se han desarrollado con éxito nuevos cebadores y/o se han modificado otros para mejorar la amplificación PCR en las regiones rps3-rpl16 e ITS. Los resultados obtenidos han mostrado una alta variabilidad genética y han revelado la existencia de dos linajes divergentes en Funaria hygrometrica. Asimismo, los niveles significativos de la prueba de Mantel han sugerido que Funaria hygrometrica posee una variación adaptativa a lo largo de Sierra Nevada. Palabras clave: briófitos, musgos, Funaria hygrometrica, Sierra Nevada, España, marcadores moleculares, ADN-cloroplastidial, ADN-mitocondrial, ADN-nuclear, ITS, microsatélites, AFLP, análisis filogenético, análisis de la estructura secundaría, exploración de genoma, loci sometidos a selección, variación adaptativa, distribución de musgos, pruebas de Mantel. Abstract in English (140 words) The genetic variability in the common cord moss Funaria hygrometrica and its relation to climate change adaptation processes in Mediterranean high mountain of Sierra Nevada (Spain) were studied. Four DNA regions were sequenced (ITS1 and ITS2 nuclear spacers, rps3-rpl16 chloroplast DNA region, and rpl5-rpl16 mitochondrial intergenic spacer). Two fingerprinting techniques (microsatellites and AFLP) were used to complement the sequence data. A genome scan method was applied on the AFLP data in order to find loci under selection. New and/or modified primers were developed to improve the PCR amplification for the nuclear ITS spacer and the chloroplast rps3-rpl16 region. The results obtained showed a high genetic variability and revealed the existence of two divergent lineages of Funaria hygrometrica. Based on the statistical Mantel test, the significant levels of correlation suggested that Funaria hygrometrica possesses an adaptive variation along Sierra Nevada Mountains. Keywords: bryophytes, mosses, Funaria hygrometrica, Sierra Nevada, Spain, molecular markers, chloroplast DNA, mitochondrial DNA, nuclear DNA, ITS, microsatellite, AFLP, phylogenetic analysis, secondary structure analysis, genome scan, loci under selection, adaptive variation, mosses distribution, Mantel tests.

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