Estudio de la patogenicidad de las variantes genéticas desmosómicas en las miocardiopatías y la muerte súbita

Abstract

Este estudio trata de evaular la correlación entre la patogenicidad de las alteraciones genéticas encontradas en la población de estudio y el desarrollo de la enfermedad de los individuos (afectados de Miocardiopatía Arritmogénica de Ventrículo Derecho, Miocardiopatía Dilatada o Síndrome de la Muerte Súbita Arrítmica). Para esto realizamos el análisis por secuenciación de los genes DSP, PKP2, DSG2, DSC2, JUP, PLN y LMNA ya que determinados cambios en la secuencia aminoacídica de estos se asocia a perfiles fenotípicos y pronósticos específicos. Hemos realizado además un estudio in silico mediante software predictores para ayudarnos a valorar la patogenicidad de las variantes encontradas. En determinado número de casos, el resultado obtenido por secuenciación coincide con la predicción de los softwares, pero hay ocasiones que se han obtenido resultados contradictorios dificultando de esta manera un diagnóstico genético claro. Sin embargo, hay ocasiones en las que en mediante el estudio por secuenciación no se detecta ninguna mutación causante de enfermedad. En estos casos hemos utilizado la técnica del MLPA buscado grandes inserciones y/o deleciones en aquellos pacientes con sospecha de causa genética de patología pero con estudio de secuenciación negativo. Ocurre esto con una de las familias incluidas en el estudio; tras no encontrar la causa genética de la patología por secuenciación directa, sometimos las muestras a MLPA y encontramos una gran deleción en el exón 8 del gen PKP2. Debido a que en ocasiones, familias no emparentadas a priori, son portadoras de una misma mutación, realizamos el análisis de haplotipos con marcadores microsatélites para buscar un efecto fundador y conocer el número de generaciones que han transcurrido desde que se originó la mutación. En nuestro caso, 3 familias no emparentadas, han resultado tener un antecesor común como origen de la mutación que afecta a las tres. This study attempts to evaulate the correlation between the pathogenicity of the genetic alterations found in the study population and the development of the disease of the individuals (affected with Arrhythmogenic Right Ventricular Myocardiopathy, Dilated Cardiomyopathy or Arrhythmic Sudden Death Syndrome). For this we performed the sequencing analysis of the DSP, PKP2, DSG2, DSC2, JUP, PLN and LMNA genes since certain changes in the amino acid sequence of these genes are associated with phenotypic profiles and specific prognoses. We have also performed an in silico study using software predictors to help us evaluate the pathogenicity of the variants found. In a number of cases, the result obtained by sequencing coincides with the prediction of the software, but there are occasions that contradictory results have been obtained, making it difficult to obtain a clear genetic diagnosis. However, there are occasions we can´t find a disease-causing mutation by sequencing. In these cases we have used the MLPA technique for large insertions and / or deletions in those patients with suspected genetic cause of pathology but with a negative sequencing study. This occurs with one of the families included in the study; After not finding the genetic cause of the pathology by direct sequencing, we submitted the samples to MLPA and found a large deletion in exon 8 of the PKP2 gene. Because sometimes unrelated families are carriers of the same mutation, we performed the analysis of haplotypes with microsatellite markers to find a founding effect and to know the number of generations that have elapsed since the origin of the mutation. In our case, 3 unrelated families have been found to have a common ancestor as the origin of the mutation that affects all three