Genetic screening of diploid and tetraploid cotton cultivars based on retrotransposon microsatellite amplified polymorphism markers (REMAP)

Abstract

Abstract Continuous artificial selection and cultivation of cultivars has led to genetic erosion and loss of useful genetic loci from the available germplasm. The objective was to evaluate diploid and tetraploid cottons cultivars with REMAP. Low genetic variability within each cultivar was observed, but a high genetic variability occurred within each species (18-68%). AMOVA test revealed 63% of total genetic variability occurred due to among species genetic difference. Unique alleles were detected in the studied species, that can be used for species discrimination. REMAPs could efficiently discriminate the studied diploid from tetraploid species and may be useful for fast screening, as genetic fingerprinting of large cotton germplasm and for planning future hybridization programs.

Resumen: La selección artificial continuada y el uso de variedades ha llevado a erosión genética y pérdida de loci genéticos del germoplasma disponible. El objetivo fue evaluar variedades diploides y tetraploides de algodón por REMAP. Se observó baja variabilidad gené- tica dentro de cada variedad, pero alta dentro de cada especie (18- 68%). El AMOVA reveló que el 63% de la variabilidad genética total se produjo debido a diferencia entre especies. Se detectaron alelos únicos en las especies estudiadas, que pueden ser empleados para discriminación. REMAP podrían discriminar eficazmente las especies diploides de las tetraploides y ser últiles para el cribado rápido, actuar como huella genética del gran germoplasma de algodón y para la planificación de programas de hibridadción.