Estudio de la relajación vibracional de N-metilacetamida en disolución acuosa

Abstract

El objetivo de la presente tesis doctoral es llevar a cabo simulaciones de la relajación vibracional y la redistribución intramolecular de la N-metilacetamida deuterada (NMAD) en solución acuosa (D2O), utilizando Dinámica Molecular clásica de no equilibrio y simulaciones híbridas clásico-cuánticas. Para este fin, utilizamos los modos normales de equilibrio (ENM) de la NMAD como coordenadas a propagar, mientras que analizamos los resultados utilizando los modos normales instantáneos (INM). De este modo podemos realizar simulaciones en las que uno o más ENM permanecen congelados, lo que facilita el análisis de los flujos de energía vibracional. En el caso de las simulaciones híbridas clásico-cuánticas, este esquema resulta idóneo para considerar uno o varios ENM como cuánticos, mientras que el resto de grados de libertad se tratan desde un punto de vista clásico.

A partir de estas consideraciones hemos estructurado la presente tesis como sigue. En los Capítulos 2 y 3 detallamos las técnicas de Dinámica Molecular clásica y los tratamientos híbridos clásico-cuánticos. En el Capítulo 4 aplicamos estas metodologías a la descripción de la relajación vibracional del sistema NMAD/D2O, considerando la excitación de los modos amida I y de las tensiones simétricas de los grupos metilo. Concluimos con el Capítulo 5 donde resumimos las principales conclusiones de la tesis y añadimos la relación de las citas bibliográficas.