Browsing by Subject "Ciencias biomédicas"
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- PublicationOpen AccessAplicación de la bioinformática en la descripción y resolución de patologías hematológicas y mecanismos biológicos relacionados(Universidad de Murcia, 2025-03-25) Garrido Rodríguez, Pedro; Corral de la Calle, Javier; Escuela Internacional de DoctoradoLa alta capacidad de generación de datos ómicos en los últimos años ha forzado la implementación de sistemas de análisis automatizados que permitan la gestión e interpretación de grandes cantidades de información. Con todo, la generación de grandes cantidades de datos por cada paciente, la incorporación de diferentes ómicas y el modelado por ordenador en biomedicina hacen necesaria la presencia en los laboratorios experimentales de esta disciplina del bioinformático de cabecera, con la finalidad de poder tratar adecuadamente todo este conocimiento. El presente trabajo sirve como reflejo de estas nuevas necesidades computacionales en grupos experimentales. Concretamente, del grupo de Hematología y Oncología Clínico Experimental de la Universidad de Murcia entre los años 2020 y 2024. En esta Tesis Doctoral se recogen resultados de investigación bioinformática en el área del modelado molecular, la obtención y estudio de variantes germinales, el desarrollo de nuevos programas para el procesado de datos de secuenciación por lecturas largas y su aplicación práctica al estudio de la fisiopatología hepática. Así, se ha podido comprobar que, si bien se han producido avances de gran importancia en los últimos años en la predicción estructural de proteínas en base a su secuencia, quedan aún pendientes avances para comprender realmente los mecanismos que determinan el plegamiento de una secuencia dada, como muestran los resultados de AlphaFold para diferentes conformaciones de serpinas como la antitrombina, que en este estudio fue incapaz de mostrar ninguna estructura de esta que no fuese la nativa, a pesar de existir, incluso para la secuencia silvestre, otras posibles estructuras que AlphaFold no es capaz de considerar a día de hoy. Aunque ya se había descrito la relación entre la agenesia de vena cava y un mayor riesgo trombótico, mediante estudios de exomas se ha podido constatar cómo la agenesia de vena cava está relacionada con la aparición de trombofilias en genes de la hemostasia primaria que causarían un evento trombótico durante el desarrollo embrionario. Esta podría ser la razón de la malformación y justificaría por otro lado los eventos trombóticos que ocurren en la etapa adulta. En esta memoria se recoge igualmente el desarrollo de dos protocolos de análisis para datos de secuenciación por nanoporos, permitiendo un procesado estándar de muestras secuenciadas por esta tecnología, explotando sus capacidades (definición de grandes haplotipos, regiones repetitivas, detección de variantes estructurales), buscando minimizar sus limitaciones, mediante el uso de herramientas de amplio uso en la comunidad científica en torno a estas tecnologías, y facilitando la orquestación de los diferentes pasos en equipos de características muy variables, desde configuraciones modestas a grandes servidores de computación. Este trabajo es también el primero, hasta donde sabemos, que realiza una descripción detallada del perfil epitranscriptómico del hígado en pacientes con obesidad y distinto grado de enfermedad hepática, lo que podría ayudar a comprender nuevos aspectos sobre la evolución de las condiciones hepáticas y sobre las rutas metabólicas que puedan ser de interés desde el punto de vista diagnóstico o terapéutico. Por último, se pudo describir igualmente el proceso de diferenciación hepática desde células pluripotentes inducidas a organoides hepáticos. Se observó en la expresión diferencial la aparición en los organoides de anotaciones relacionadas con la formación de estructuras anatómicas asociadas a órganos internos, así como funciones propias del hígado. Al mismo tiempo, se arrojó algo de luz sobre el perfil y cambios epitranscriptómicos en ambos estadios, encontrando que las modificaciones m6A del ARN tendrían relación tanto con la estabilidad de los transcritos, así como parecen tener conexión con el proceso mismo de especialización celular.
- PublicationOpen AccessCalidad de los recursos digitales en Enfermería : análisis de bases de datos en línea(2014-01-13) Guillén Ríos, Juan Francisco; Ayuso García, María Dolores; Departamento de Información y DocumentaciónObjetivo: Analizar y evaluar la calidad de las Bases de Datos (BBDD) Bibliográficas en línea más importantes de la actualidad útiles para Enfermería (CUIDEN-Plus, CUIDATGE, ENFISPO, IBECS, IME, MEDES, DIALNET, BDENF, LILACS, CINAHL, PROQUEST NURSING & ALLIED HEALTH SOURCE, PUBMED). Metodología: Hemos formulado una metodología analítico-descriptiva e informativa creada “ad hoc”, en la que aportamos como eje central para el desarrollo de nuestro trabajo el “Protocolo de actuación para la evaluación de fuentes de información digitales publicadas en Internet” y su “Guía de Buenas Prácticas” de 2003 y 2006 respectivamente planteado por las doctoras y expertas en esta materia Mª Dolores Ayuso García y Victoria Martínez Navarro. Para ello aplicamos criterios de evaluación específicos para este tipo de recursos documentales pertinentes para Enfermería que estructuramos en secciones (Micronavegación, Macronavegación y Usabilidad), y dentro de cada sección englobamos parámetros que se subdividen en indicadores específicos de evaluación a los que asignamos puntuaciones que oscilan de 0 a 3 puntos. Resultados: A nivel global, podemos indicar que la media de puntuaciones es de 2.07 puntos teniendo un máximo de 2.77 puntos que recae en la Base de Datos (BDs) PUBMED obteniendo la calificación de calidad EXCELENTE y un mínimo de 1.14 puntos que corresponde a CUIDATGE y la calificamos como de calidad INSUFICIENTE según el sistema de puntuaciones propuesto. Hemos observado que tres BBDD españolas de las evaluadas, CUIDEN Plus, MEDES y DIALNET como Repositorio, logran unas valoraciones de 2.23, 2.31 y 2.06 respectivamente. Dos BBDD de origen español son las únicas que reciben la calificación de INSUFICIENTES en calidad, ENFISPO y CUIDATGE. Por secciones, podemos mencionar, que la sección de Micronavegación es la que ofrece los resultados de puntuaciones más elevadas con una media de aproximadamente 2.33, siendo el valor más alto de 2.94 (CINAHL) y un mínimo de 1.41 (CUIDATGE). Destacan cinco BBDD analizadas que obtienen una calificación de EXCELENTE en el cumplimiento de los indicadores de esta sección, entre ellas una española específica de Enfermería, CUIDEN Plus, además de CINAHL, PUBMED, PN&AHS y LILACS. La sección de Macronavegación es la que ofrece los resultados de puntuaciones algo más bajas si lo comparamos con la sección precedente con una media de aproximadamente 1.83, siendo el valor más alto de 2.69 (PUBMED) y un mínimo de 1.06 (CUIDATGE). La sección de Usabilidad es la que muestra resultados más bajos si se coteja con las otras secciones con una media de aproximadamente 1.61, siendo el máximo de 2.60 (PUBMED y PN&AHS) y el mínimo de 0.53 (CUIDATGE). Conclusiones: A grandes rasgos, podemos decir que todos los recursos evaluados se preocupan en el cumplimiento de los criterios mínimos exigidos en la sección de Micronavegación, a excepción de CUIDATGE. En general, los recursos se centran más en los aspectos de organización y estructura de la publicación o micronavegación que en los aspectos de encaje del recurso en el contexto global de la WWW o macronavegación, o por las características relativas a la usabilidad de la BDs. Las fuentes norteamericanas analizadas son las que consideran en mayor medida el posicionamiento y la interconexión con otros recursos en el contexto global de la Web. La excepción grave en este sentido la protagonizan BDENF, IBECS y CUIDATGE. Las BBDD angloamericanas valoradas, en general, se pueden considerar como las de mayor calidad al ostentar puntuaciones elevadas en todos los parámetros e indicadores evaluados de cada una de las secciones. Obtienen valoraciones importantes en las secciones consideradas críticas como la Macronavegación y la Usabilidad. Palabras Clave: Bases de Datos, Recursos documentales digitales, Recursos documentales en línea, Productos documentales digitales, Productos documentales en línea, Fuentes de información digitales, Fuentes de información en línea, Calidad de bases de datos, Evaluación de calidad, Control de calidad, Protocolo de evaluación de calidad, Micronavegación, Macronavegación, Usabilidad, Fuentes de información en Enfermería, Enfermería.ABSTRACT: Objective: To analyze and evaluate the quality of the Databases Bibliographical major online now useful for Nursing (CUIDEN-Plus, CUIDATGE, ENFISPO, IBECS, IME, MEDES, DIALNET BDENF, LILACS, CINAHL, Proquest NURSING & ALLIED HEALTH SOURCE, PUBMED). Methods: We have developed an analytic-descriptive and informative methodology created "ad hoc", in which we provide as central to the development of our work the "Protocol for the evaluation of digital information sources published on the Internet" and its "Good Practice Guide ", 2003 and 2006 respectively raised by doctors and experts in this field María Dolores Ayuso García and Victoria Martínez Navarro. To do this, we apply specific evaluation criteria for this type of information resources relevant to nursing we structure into sections (Micronavegation, Macronavegaction and Usability), and within each section, we include parameters which are subdivided into specific evaluation indicators to which we assign scores ranging from 0 to 3 points. Results: Globally, we can say that the average scores is 2.07 points taking up to 2.77 points falling on the Database PUBMED obtaining EXCELLENT quality rating and a minimum of 1.14 points corresponding to CUIDATGE classified as INSUFFICIENT quality scores according to the system proposed. We observed that three of the Spanish Databases evaluated CUIDEN Plus, MEDES and DIALNET as repository, manage valuations of 2.23, 2.31 and 2.06 respectively. Two Spanish Databases are the only ones that are rated as INSUFFICIENT, ENFISPO and CUIDATGE. By sections, we can mention that Micronavegación section is offered the highest scores results with an average of about 2.33, being the highest value of 2.94 (CINAHL) and a minimum of 1.41 (CUIDATGE). We highlight five analyzed databases which get EXCELLENT rating in compliance with the indicators in this section, including a specific Spanish Nursing Database, CUIDEN Plus, in addition to CINAHL, PUBMED, PN & AHS and LILACS. Macronavegation section is offered results somewhat lower scores when compared to the previous section with an average of about 1.83, the highest value being 2.69 (PUBMED) and a minimum of 1.06 (CUIDATGE). Usability section is showing results lower if compared against the other sections with an average of about 1.61, the maximum of 2.60 (PUBMED and PN & AHS) and the minimum of 0.53 (CUIDATGE). Conclusions: In general terms, we can say that all resources evaluated take care in meeting the minimum criteria required by section Micronavegación except CUIDATGE. In general, resources are focused more on the organization and structure of the publication or micronavegation that lace aspects of the resource in the overall context of the WWW or macronavegation, or the characteristics relating to the usability of the Database. American analyzed sources considering further the positioning and interconnection with other resources in the overall context of the Web. In this sense, the fatal exception is starring by BDENF, IBECS and CUIDATGE. In general, the Anglo-American Databases can be considered as the highest quality to hold high scores in all evaluated parameters and indicators for each of the sections. They get major assessments in sections considered critical as Macronavegation and Usability. Keywords: Databases; Digital documental resources; Online documental resources; Digital documental products; Online documental products; Digital information sources; Online information sources; Databases Quality; Quality assessment; Quality Control; Quality assessment protocol; Micronavegation; Macronavegation; Usability; Nursing information sources; Nursing.
- PublicationOpen AccessEstudio de la eficacia de bioestimulantes en un modelo animal de exéresis cutánea en ratón SKH1/CR inmunocompetente(Universidad de Murcia, 2019-12-09) Soler Tornero, Carlos.; López Jornet, María Pía; Martínez Díaz, F.; Escuela Internacional de DoctoradoLa piel es el órgano más extenso del cuerpo humano y constituye una barrera eficaz contra diferentes tipos de agentes externos. Cuando hay una ruptura de la integridad de esta barrera se produce una herida. En la actualidad hay una fuerte demanda de productos de origen natural para el tratamiento de las lesiones cutáneas. El objetivo del presente estudio fue probar la eficacia de dos compuestos bioestimulantes constituidos por elastina e hidrólisis pulmón-pepsina a diferentes concentraciones en la curación de las heridas. Para ello se llevó a cabo un estudio prospectivo de 14 días de duración utilizando ratones SKH-1. A los animales se les realizó exéresis cutáneas en la zona dorsal utilizando para ello un punch de 4 mm de diámetro. Cada día fueron aplicados los productos directamente sobre la herida, y se realizaron valoraciones macroscópicas, ecográficas, microscópicas e inmunohistoquímicas en los días cero, tercero, séptimo y décimo cuarto del estudio. A nivel macroscópico, se encuentra a lo largo de todo el estudio una mejoría aparente en todos los grupos. Es en el grupo tratado elastina 25% donde se aprecia una peor cicatrización a los 7 días. Las ecografías modo B del área de la lesión obtenidas son diferentes en los distintos grupos. Un mejor resultado se observó en el grupo 4 (hidrólisis 25%). En cuanto a la ecografía doppler encontramos diferencias estadísticamente significativas en el día 3 del estudio entre los distintos grupos 2 (Elastina 50%) y 4 (hidrólisis 25%), no manteniéndose en los otros períodos del estudio. A nivel histológico, se observan diferencias destacables en la inflamación a los 7 días comportándose mejor el grupo 4 (hidrólisis 25%). La presencia de infiltrado inflamatorio era mayor en las muestras del tiempo de estudio más corto (3 días). La proliferación celular está algo más activa en fases intermedias. Se observó un marcaje leve en el grupo 1 (Elastina 50% 3 días), así como en los grupos 2 (Elastina 50% 7 días) y 13 (Placebo 3 días). Destacaba el tratamiento con HP al 50%, que, en todos los tiempos de estudio, la epidermis mostraba gran actividad proliferativa. Se hacen necesarios más estudios para poder comprender el papel de los productos del estudio en el proceso cicatricial, así como su posible extrapolación para su uso en humanos.
- PublicationMetadata onlyGestión de la información sanitaria por los médicos de Atención Primaria / Juan Enrique Pereñíguez Barranco ; dirección Mª Dolores Pérez Cárceles y Aurelio Luna Maldonado.(Murcia : Universidad de Murcia, Departamento de Ciencias Sociosanitarias,, 2004) Pereñíguez Barranco, Juan Enrique
- PublicationOpen AccessIdentificación de biomarcadores de úlcera gástrica en caballos(Universidad de Murcia, 2025-12-22) Matas Quintanilla, Marta; Gutiérrez Montes, Ana María; Rodolfo Ipharraguerre, Ignacio; Sin departamento asociado; Escuela Internacional de DoctoradoDada la elevada prevalencia del síndrome de úlcera gástrica equina (EGUS), los múltiples factores de riesgo implicados, la inespecificidad de sus signos clínicos y la complejidad diagnóstica de la gastroscopia, que constituye el único método diagnóstico antemortem aceptado y fiable, en esta tesis doctoral se planteó la identificación y validación de biomarcadores en fluidos biológicos mínimamente invasivos, que pudieran contribuir a la detección, cribado y monitorización de la enfermedad.En esta tesis doctoral se llevaron a cabo tres experimentos: 1) Identificación y validación de biomarcadores de úlceras gástricas en muestras de suero y saliva de caballos mediante técnicas proteómicas en gel; 2) Obtención de métodos cuantitativos apropiados para medir biomarcadores que faciliten la detección de úlceras gástricas en caballos; y 3) Evaluación del comportamiento de los biomarcadores de úlceras gástricas en caballos en condiciones clínicas. En dichos experimentos se trabajó con tres grupos de caballos. El primero estuvo constituido por ocho caballos sanos a los que se les indujeron úlceras gástricas experimentales. El segundo grupo incluyó veinte caballos de alta competición clínicamente sanos y veintiocho caballos con signos clínicos compatibles con úlceras gástricas y lesiones confirmadas mediante gastroscopia. El tercer grupo estuvo formado por caballos con lesiones ulcerativas en la mucosa gástrica, tanto con signos clínicos (n=28) como sin ellos (n=28), junto con un grupo control adicional de veintidós caballos clínicamente sanos y sin lesiones en la gastroscopia.En el Experimento 1, de carácter experimental, se trabajó con los ocho caballos a los que se les indujeron las úlceras gástricas mediante privación de alimento. Usando técnicas proteómicas (2DE y LC-MS/MS), se identificaron quince proteínas en saliva y cinco en suero con diferencias significativas entre los animales antes y después de la inducción de las úlceras. De esas proteínas, se validaron nueve en saliva (IL1-F5, IL1-F6, PIP, FABP5, CA-VI, albúmina, Apo A-4, ###1-antitripsina y serotransferrina), y las tres últimas también en suero, mediante SDS-PAGE y Western blotting.Posteriormente, en el Experimento 2, cinco de estos biomarcadores fueron cuantificados en saliva (IL1-F5, PIP, CA-VI, albúmina y serotransferrina), junto con dos marcadores de inflamación (ADA y S100A12). Los ensayos desarrollados presentaron precisión, exactitud y sensibilidad adecuadas, de acuerdo con las guías generales. En el Experimento 3, se evaluó el comportamiento de los siete biomarcadores bajo distintos escenarios clínicos y se estudió su valor diagnóstico. Los animales con úlceras mostraron concentraciones más altas que los animales sanos, con variaciones relacionadas con el tipo de lesión y la presencia de signos clínicos. El análisis de sus curvas ROC arrojó valores de AUC entre 0,80 y 0,84, para seis de los biomarcadores evaluados (IL1-F5, CA-VI, serotransferrina, albúmina, ADA y S100A12), lo que sugiere tener potencial clínico real como herramientas complementarias a la gastroscopia para la identificación temprana de EGUS. Únicamente PIP presentó un rendimiento limitado como marcador individual.Los resultados confirman que la saliva es un fluido biológico idóneo para la evaluación de biomarcadores asociados al EGUS, ya que permite una recogida rápida, sencilla y no invasiva. Se aporta, por primera vez, un conjunto validado de biomarcadores y métodos cuantitativos aplicables en la práctica clínica, lo que sienta las bases para el desarrollo de paneles multibiomarcadores que complementen la gastroscopia, actualmente el único método diagnóstico antemortem aceptado. Los biomarcadores evaluados abarcan diversas vías fisiopatológicas implicadas en el EGUS, incluyendo la respuesta inmune, la inflamación sistémica, la protección de la mucosa gástrica y el daño tisular, lo que refuerza su relevancia biológica. En conjunto, estos hallazgos respaldan su potencial para mejorar la detección temprana, la monitorización evolutiva y la toma de decisiones clínicas, contribuyendo a una gestión más eficaz y al bienestar de los caballos afectados.